Abstract
Trichophyton interdigitale is a significant pathogen responsible for dermatophytosis, including tinea unguium & tinea pedis.A fungal genome contains numerous copies of ribosomal DNA (rDNA). (ITS) region can be used to analyze relationships between closely related taxa.The genetic variants of the ribosomal sequences were investigated to assess the pattern of biological diversity of three isolates (assigned S4, S6 and S7) collected in Karbala province.Our results indicated the exact identity of the amplified samples. Sequencing reactions indicated that the identity of S4, S6, and S7 samples was Trichophyton interdigitale. phylogenetic analyses also confirmed their positions within their corresponding clades accordingly.
Keywords
Trichophyton interdigitale، تسلسل الحمض النووي، الشجرة التطورية، NCBI، داء الفطريات الجلدية، Trichophyton mentagrophytes
Abstract
Trichophyton interdigitale هو مسبب مرضي مهم مسؤول عن فطريات الجلد، بما في ذلك tinea unguium و tinea pedis. يحتوي الجينوم الفطري على نسخ عديدة من الحمض النووي الريبوسومي (rDNA). يمكن استخدام منطقة (ITS) لتحليل العلاقات بين الأصناف ذات الصلة الوثيقة. تم التحقيق في المتغيرات الجينية لتسلسلات الريبوسوم لتقييم نمط التنوع البيولوجي لثلاث عزلات (تم تعيينها S4 و S6 و S7) تم جمعها في محافظة كربلاء. أشارت نتائجنا إلى الهوية الدقيقة للعينات المكبرة. أشارت تفاعلات التسلسل إلى أن هوية عينات S4 و S6 و S7 كانت Trichophyton interdigitale. كما أكدت التحليلات التطورية أيضًا مواقعها داخل الفروع المقابلة لها وفقًا لذلك.
Keywords
dermatophytosis
DNA Sequencing
NCBI
phylogenetic tree
Trichophyton interdigitale
Trichophyton mentagrophytes