Abstract
The risk of P. equorum infection in horses remains critical. Little studies were conducted to investigate prevalence and molecular analysis of P. equorum in Baghdad city, Iraq. In this study traditional detection followed by molecular technique depending on ITS-2 region were used as an attempt to evaluate this nuclear region as a genetic marker to diagnose the parasitic infection. One hundred and thirty-eight fecal samples of horses were collected and examined by direct wet mount smears, floatation method by NaCl. Extraction of genomic material, nested PCR was done followed by phylogenic analysis depending on ITS-2 region performed for the first time in Iraq and genetic substitutions to analyze Iraqi horses. Nested PCR were done after determining the total infection rate 6.52% by conventional technique, including 3.84% in males and 10% in females with significant difference. Highly infection rate 11.42% was recorded in the age group under 2 years and the lower infection rate 4% was found in the age group between 2-4 years with significant difference. The Iraqi isolates were recorded in the Gen Bank under the accession numbers MZ400507.1, MZ400508.1, MZ400509.1, and MZ4005010.1; while, phylogenetic analysis recorded an identity range between 97-100% with China, Australia and USA isolates. P. equorum is more distributed in younger horses than elderly in Baghdad city and ITS-2 region is a certain molecular marker for detection P. equorum isolates in Iraqi horses.
Keywords
Internal transcribed spacer-2 region
Iraq
nested PCR
P. equorum
phylogenetic tree
Abstract
يؤدي الخمج بديدان إسكارس الخيول الى حدوث أذى في الخيول، توجد دراسات جزيئية قليلة لتحديد نسبة انتشار الطفيلي في مدينة بغداد، العراق. اعتمدت الدراسة الحالية على الطرائق التقليدية لتشخيص الطفيلي ويتبعه الكشف الجزيئي لتأكيد الاصابة اعتمادا على منطقة فاصل نسخ داخلي-2 كمحاولة لتقييمها كعلامة وراثية لتشخيص العدوى بالطفيلي. تم جمع مائة وثمانية وثلاثين عينة براز من الخيول مع تحديد عمر وجنس الحيوانات. تم فحص عينات البراز بعمل مسحات مباشرة، طريقة التطويف بواسطة كلوريد الصوديوم. تم استخلاص المادة الوراثية وتبعه أجراء تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل من ثم تحديد الشجرة التطورية لتحليل عزلات الطفيلي التي تصيب الخيول ولأول مرة في العراق. تم إجراء تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل بعد تحديد معدل الإصابة الكلي 6,52٪ بالطرائق التقليدية، وسجلت اقل نسبة إصابة 3,84٪ في الذكور والأعلى 10٪ في الإناث مع اختلاف معنوي. تم تسجيل ارتفاع معدل إصابة 11.42٪ في الفئة العمرية أقل من عامين، بينما وجد أقل معدل الإصابة 4٪ في الفئة العمرية بين 2-4 سنوات مع وجود فرق معنوي. تم تسجيل العزلات المحلية في بنك الجينات العالمي؛ بينما سجل تحليل الشجرة التطورية تطابق 97-100٪ مع عزلات الصين وأستراليا والولايات المتحدة الأمريكية. ويعد طفيلي إسكارس الخيول الأكثر انتشارا في الخيول ذات الأعمار الصغيرة في مدينة بغداد، وتعد فاصل نسخ داخلي-2 منطقة وراثية يمكن اعتمادها بشكل مؤكد في تشخيص الخمج بالطفيلي في الخيول.
Keywords
إسكارس الخيول، تفاعل البلمرة المتسلسل المتداخل، منطقة فاصل نسخ داخلي-2، الشجرة الوراثية