Journal of the Faculty of Medicine Baghdad

1

A Computational Analysis of Four RETNSNPs in Iraqi Women with Breast cancer: A Cross-Sectional Study

Khadija A. Sahan, Zahraa A. Sahan, Thualfiqar Gh. Turki

Pages: 359-367 English

Abstract

Background: Breast cancer is a leading malignancy in women, shaped by genetic and environmental factors. Resistin, a potential chemotherapy target, may contribute to chemoresistance when mutated. This study applies computational methods to analyze how single-nucleotide polymorphisms alter resistin’s structure and function, potentially reducing its chemotherapy sensitivity.
Methods: A total of 105 fresh blood samples were collected from patients recruited from the Oncology Teaching Hospital, Medical City, Baghdad, Iraq. between March-2020 and September-2023. Samples were classified into 3 groups of 35 samples each: control, benign and patients. DNA extraction, PCR, Sanger sequencing and computational approaches were used to analyze four resistins' polymorphisms, namely rs1862513, rs3219175, rs34788323, and rs3745367. Functional impacts were predicted using HaploReg (regulatory effects), RegulomeDB (regulatory annotations), PolyPhen-2 (pathogenicity), ProtParam (protein stability), and SWISS-MODEL (3d structural modelling). Data entry, descriptive statistics, and statistical analyses were performed using IBM SPSS Statistics version 20. The chi-squared test was applied, and a p-value <0.05 was considered statistically significant.
Results: Four Single-nucleotide polymorphisms in resistin showed notable associations with breast cancer. rs1862513: GG genotype was more frequent in malignant (40%) and benign (26%) cases versus controls (0%), indicating a strong link to disease presence. rs3219175: AA genotype showed a significant difference, while GA was non-significant. rs3745367 (phenylalanine-41-proline) (AA): identified as a risk factor (OR = 1.44) with a PolyPhen-2 score of 0.999, suggesting structural alterations in resistin. rs34788323 (arginine-65-lysine) (TT): acted as a protective factor (OR = 2.07) and was predicted benign (score = 0.015; sensitivity = 0.96; specificity = 0.79). Additionally, rs1862513 and rs3219175 may affect transcription factor binding sites.
Conclusion: In silico analysis predicts that specific resistins' polymorphisms may impair protein function and alter its structure and reduce chemotherapy sensitivity in Iraqi breast cancer patients. These variants could serve as biomarkers for personalized therapy but need experimental validation.

Keywords

Breast Cancer Haploreg; Protparam Polyphen-2 Resistin

Abstract

خلفية البحث: يُعد سرطان الثدي من أكثر الأورام الخبيثة شيوعًا بين النساء، ويتأثر بعوامل وراثية وبيئية. تُعتبر بروتين الريستين (Resistin) هدفًا محتملًا للعلاج الكيميائي، وقد تسهم الطفرات فيه في مقاومة العلاج. تهدف هذه الدراسة إلى توظيف المنهجيات الحاسوبية لتحليل التأثيرات البنيوية والوظيفية للطفرات الجينية أحادية النوكليوتيد (SNPs) في بروتين الريستين، وبيان كيف يمكن أن تُحدث هذه الطفرات تغيرات في بنية البروتين ووظيفته، مما يجعله أقل استجابة للعلاج الكيميائي.
طرق العمل: تم جمع 105 عينة دم حديثة من مريضات من مستشفى الأورام التعليمي، مدينة الطب، بغداد – العراق، وذلك خلال الفترة من مارس 2020 إلى سبتمبر 2023. تم تقسيم العينات إلى ثلاث مجموعات (35 عينة لكل مجموعة): مجموعة الضبط (الأصحاء)، مجموعة الأورام الحميدة، ومجموعة المرضى المصابين بسرطان الثدي. تم إجراء استخلاص الحمض النووي (DNA)، تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR)، التسلسل باستخدام تقنية سانجر، ومن ثم تحليل الطفرات الأربعة (rs1862513 ، rs3219175، rs34788323، rs3745367) باستخدام أدوات حاسوبية. HaploReg: لتحليل التأثيرات التنظيمية RegulomeDB للتعليقات التنظيمية و PolyPhen-2: لتقييم التأثير المرضي للطفرات و ProtParam لتحليل استقرار البروتين و SWISS-MODEL لنمذجة البنية ثلاثية الأبعاد للبروتين. تم إدخال البيانات وتحليلها إحصائيًا باستخدام برنامج SPSS الإصدار 20، وتم استخدام اختبار مربع كاي ، مع اعتبار أن قيمة (P<0.05) دالة إحصائيًا.
النتائج:أظهرت الطفرات الأربعة المدروسة في جين الريستين ارتباطًا واضحًا بسرطان الثدي: كان النمط الجيني rs1862513 GG أكثر شيوعًا في حالات الأورام الخبيثة (40%) والحميدة (26%) مقارنةً بمجموعة الضبط (0%)، مما يشير إلى ارتباط قوي بالمرض. النمط الجيني rs3219175 AA أظهر فرقًا معنويًا، في حين لم يكن النمط rs3745367 GA ذا دلالة إحصائية. تحويل الحمض الأميني فينيل ألانين إلى برولين في الموقع 41 – AA): اعتُبر عامل خطر (نسبة الأرجحية OR = 1.44)، مع نتيجة PolyPhen-2 بلغت 0.999، مما يشير إلى تغيرات هيكلية كبيرة في البروتين.
rs34788323 تحويل الحمض الأميني أرجينين إلى لايسين في الموقع 65 – TT): عمل كعامل وقائي (OR = 2.07)، وتوقعت أداة PolyPhen-2 أنه طفرة حميدة (الدرجة = 0.015؛ الحساسية = 0.96؛ النوعية = 0.79).
كما أظهرت النتائج أن الطفرتين rs1862513 و rs3219175 قد تؤثران على مواقع ارتباط عوامل النسخ.
الاستنتاج: تتنبأ التحليلات الحاسوبية بأن بعض الطفرات في جين الريستين قد تؤثر سلبًا على وظيفة البروتين وتقلل من حساسيته للعلاج الكيميائي لدى مريضات سرطان الثدي العراقيات. كما كشفت نماذج البنية ثلاثية الأبعاد عن تغييرات في الشكل البنيوي للبروتين الطافر مقارنة بالبروتين الطبيعي، مما يشير إلى آليات محتملة لمقاومة العلاج. تبرز هذه النتائج أهمية هذه الطفرات كواسمات جينية محتملة للعلاج الشخصي، إلا أنها تتطلب المزيد من الدراسات التجريبية لتأكيدها.

Keywords

رسستين، سرطان الثدي، haploregبروتوباترم، بوليفن، 2

2

Association of Vitamin D Receptor Gene SNP BsmI (1544410) with Axial Spondyloarthritis in Iraqi Patients Treated with Infliximab

Pages: 403-408 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Axial spondyloarthritis (AxSpA) is a chronic inflammatory disorder driven by tumor necrosis factor alpha and the interleukin-23/interleukin-17 pathway. Tumor necrosis factor alpha inhibitors such as infliximab improve outcomes, but responses vary, suggesting genetic influences; vitamin D receptor (VDR) polymorphisms—particularly BsmI (rs1544410) may modulate disease activity and therapeutic response.
Objectives: This study aimed to investigate the association between the VDR BsmI polymorphism and disease activity, as well as infliximab treatment response in patients with Axial spondyloarthritis.
Methods: A cross-sectional study was conducted on 150 AxSpA patients (108 males, 42 females) receiving infliximab for at least three months. VDR BsmI genotyping was performed using PCR-RFLP. The study took place at the Rheumatology Clinics of Baghdad Hospital, Medical City, Iraq.
Results: BsmI genotype distribution was AA (28%), AG (46%), and GG (26%), with allele frequencies of 51% (A) and 49% (G). No significant association was found between BsmI polymorphism and infliximab duration. However, a significant association was observed with disease activity. The AA and AG genotypes were also significantly associated with male gender. No significant correlations were found with other clinical features including inflammatory back pain, urinary tract infection, enthesitis, uveitis, dactylitis, psoriasis, or colitis.
Conclusion: The GG genotype was linked to an increased likelihood of inactive disease, while the AA genotype was associated with an increased risk of low disease activity. These findings suggest VDR BsmI polymorphism may influence AxSpA disease activity and response to infliximab

Keywords

Axial spondyloarthritis disease activity Infliximab single nucleotide polymorphism Tumor necrosis factor alpha vitamin D receptor

Abstract

المقدمة: يُعدُّ التهاب الفقار المحوري (AxSpA) اضطرابًا التهابيًا مزمنًا تُسهم في تسويغه كلٌّ من عامل نخر الورم ألفا (TNF-α) ومسار إنترلوكين-23/إنترلوكين-17. تُحسّن مثبِّطات عامل نخر الورم—مثل الإنفليكسيماب—المخرجات السريرية، غير أن تغاير الاستجابة بين المرضى يوحي بتأثيراتٍ جينية محتملة؛ إذ قد تُعدّل تعدُّدات أشكال جين مستقبل فيتامين د (VDR)—ولا سيما BsmI (rs1544410) —نشاطَ المرض والاستجابةَ العلاجية.
الأهداف: استقصاء العلاقة بين تعدُّد شكل VDR BsmI ونشاط المرض، وكذلك الاستجابة للعلاج بالإنفليكسيماب لدى مرضى التهاب الفقار المحوري.
الطرق: دُرست عيّنة مقطعية شملت 150 مريضًا بـ AxSpA (108 ذكور، 42 إناث) يتلقّون الإنفليكسيماب لمدة لا تقل عن ثلاثة أشهر. أُجري تحديد النمط الجيني لتعدُّد شكل BsmI بتقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل متبوعًا بتعدُّد أطوال القطع الناتجة عن إنزيمات التقييد (PCR-RFLP). أُجريت الدراسة في عيادات الروماتيزم بمستشفى بغداد، مدينة الطب، العراق.
النتائج: توزّعت الأنماط الجينية على النحو الآتي: AA (28%)، وAG (46%)، وGG (26%)، وكانت تواترات الأليلات: A = 51% وG = 49%. لم يُسجَّل ارتباط ذو دلالة إحصائية بين تعدُّد شكل BsmI ومدة العلاج الإنفليكسيماب. بالمقابل، ظهر ارتباطٌ ذو دلالة مع نشاط المرض. كما ارتبط النمطان الجينيان AA وAG على نحوٍ معنويّ بكون المريض من الذكور. ولم تُلاحظ ارتباطات معنوية مع السمات السريرية الأخرى، بما في ذلك ألم الظهر الالتهابي، والتهاب المسالك البولية، والتهاب الارتكاز، والتهاب القزحية، والتهاب الأصابع الشامل (الدكتيليتس)، والصداف، أو التهاب القولون.
الاستنتاج: ارتبط النمط الجيني GG بزيادة احتمال المرض غير النشط، في حين ارتبط النمط AA بارتفاع خطر النشاط المرضي المنخفض. تشير هذه النتائج إلى أن تعدُّد شكل VDR BsmI قد يؤثر في نشاط مرض التهاب الفقار المحوري وفي الاستجابة للإنفليكسيماب

Keywords

اللاصق الفقاري، امراض الفعالية، انلاكساماب، اشارة النيوكلاتيد المفرد، عامل الفا للاورام التخري، فايتامين د

3

The Correlation of Subfatin and Vitamin D3 in Obese and Normal Weight PCOS Patients

Walaa N. Abdulwahid, Reem M. Obaid

Pages: 378-383 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Polycystic ovarian syndrome (PCOS) is a complex endocrine problem affecting women with an estimated global prevalence of 9%, due to inherited and environmental causes. PCOS mainly impacts women aged 15-35 years, and women who are at their earliest or final period of pregnancy. Subfatin is a newly identified hormone that controls metabolism and is thought to be a biomarker for PCOS and metabolic syndrome. Vitamin D3 has an important function in the development of PCOS.
Objective: To explore the effect of obesity on Subfatin and D3 levels, and the impact of the pathophysiology of PCOS on Subfatin and D3 levels.
Methods: The total number of participants was 120: 80 females with PCOS, divided to 40 obese and 40 normal-weight, and 40 healthy females (controls). The current investigation was carried out from July to December 2024 at Kamal Al-Samarrai hospital in Baghdad, Iraq. The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to determine the subfatin serum levels. Body mass index, follicle-stimulating hormone (FSH), testosterone, estrogen, D3, and luteinizing hormone (LH) levels were all assessed. The data were examined with the origin lab software version 25. The study groups were compared using Analysis of variance (ANOVA).
Results: Serum levels of subfatin, waist circumference, LH, estrogen, and testosterone were significantly higher (P < 0.001) in PCOS women compared to the control group. FSH besides the D3 levels was lower in PCOS cases than in healthy females.
Conclusion: High levels of subfatin and low vitamin D3 levels might be implicated in the fundamental mechanisms of PCOS, irrespective of body weight.

Keywords

فرط الأندروجين، العقم، السمنة، متلازمة تكيس المبايض، السبفاتين

Abstract

الخلفية: متلازمة تكيس المبايض (PCOS) هي مشكلة غدد صماء معقدة تصيب العديد من النساء، لأسباب وراثية وبيئية. تصيب متلازمة تكيس المبايض بشكل رئيسي النساء اللواتي تتراوح أعمارهن بين 15-35 عامًا، والنساء في المراحل المبكرة أو الأخيرة من الحمل. السبفاتين هو هرمون تم اكتشافه حديثًا يتحكم في عملية التمثيل الغذائي، ويُعتقد أنه مؤشر حيوي لمتلازمة تكيس المبايض ومتلازمة التمثيل الغذائي. لفيتامين D3 دور مهم في تطور متلازمة تكيس المبايض.
الهدف: إستكشاف تأثير السمنة على مستويات السبفاتين وفيتامين D3 وتأثير الفسيولوجيا المرضية لمتلازمة تكيس المبايض على مستويات الدهون تحت الحمراء وفيتامين D3.
المنهجية: بلغ العدد الإجمالي للمشاركين 120 مشاركًا؛ منهم 80 أنثى مصابة بمتلازمة تكيس المبايض (موزعة على 40 من ذوات الوزن الزائد و40 من ذوات الوزن الطبيعي) والـ 40 المتبقية من الإناث الأصحاء. أُجريت الدراسة الحالية في الفترة من تموز إلى كانون الأول 2024 في مستشفى كمال السامرائي ببغداد، العراق. واستُخدمت تقنية مقايسة الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) لتحديد مستويات السبفاتين. وقُيِّمت مستويات كل من مؤشر كتلة الجسم، والهرمون المنبه للجريب (FSH)، والتستوستيرون، والإستروجين، وفيتامين د3، والهرمون الملوتن.(LH) وفحصت البيانات باستخدام برنامج Origin Lab الإصدار 25. وقورنت مجموعات الدراسة باستخدام تحليل التباين (ANOVA).
النتائج: كانت مستويات السبفاتين، ومحيط الخصر، والهرمون الملوتن، والإستروجين، والتستوستيرون أعلى بشكل ملحوظ (P < 0.001) لدى كل من النساء ذوات الوزن الزائد والوزن الطبيعي المصابات بمتلازمة تكيس المبايض مقارنةً بالمجموعة الضابطة. ولم يكن مستوى مؤشر كتلة الجسم في المجموعة الضابطة أقل بشكل ملحوظ من مستوى النساء ذوات الوزن الطبيعي المصابات بمتلازمة تكيس المبايض، ولكنه أقل بشكل ملحوظ من مستوى النساء المصابات بمتلازمة تكيس المبايض المصابات بالسمنة. كانت مستويات هرمون FSH، بالإضافة إلى مستويات فيتامين D3 في المصل، أقل لدى حالات متلازمة تكيس المبايض مقارنةً بالنساء الأصحاء.
الإستنتاج: قد يكون لارتفاع مستويات السبفاتين وانخفاض مستويات فيتامين د3 دور في الآليات الأساسية لمتلازمة تكيس المبايض، بغض النظر عن وزن الجسم.

Keywords

Hyperandrogenism; Obesity; Polycystic Ovary Syndrome; Subfatin; Vitamin D3

4

Comparison of Debulking Combined with Intralesional Triamcinolone Acetonide Injection Versus Debulking Alone, for the Treatment of Earlobe and Helical Keloids

Hayder R. Al-Hamamy, Yasir T. Radhi

Pages: 294-301 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Keloids of the ear present a significant clinical challenge, with surgical excision alone associated with high recurrence rates (45%–100%). Various adjuvant treatments have been explored to improve outcomes, with intra-lesional corticosteroids showing promise.
Objectives: To evaluate the effectiveness and safety of debulking combined with intralesional injection of triamcinolone acetonide versus debulking alone in treating earlobe and helical keloids.
Methods: This study was conducted at the Department of Dermatology and Venereology, Baghdad Teaching Hospital, from January 2014 to October 2015. Twenty-eight female patients with 67 keloid lesions resulting from ear piercing were enrolled and randomly divided into two groups. Group 1 underwent debulking followed by intralesional injection of triamcinolone acetonide (0.25 mg to 1 mg), while Group 2 received debulking alone. The treatment response was assessed over six months using keloid height measurements, a visual analogue scale (VAS) for improvement, patient satisfaction scores, and recurrence rates.
Results: Group 1 demonstrated more significant improvement, with a mean VAS score of 8.8 ± 2.00 compared to 3.5 ± 2.63 in Group 2. Patient satisfaction was also higher in Group 1 (8.6 ± 2.38) than in Group 2 (3.5 ± 2.40). The recurrence rate was markedly lower in Group 1 (13.3%) compared to Group 2 (92.3%). No significant side effects or systemic adverse effects were observed in either group.
Conclusion: Debulking combined with intralesional triamcinolone acetonide injection is a more effective treatment for earlobe and helical keloids than debulking alone. This approach is simple, cost-effective, and well-tolerated, leading to higher patient satisfaction and significantly lower recurrence rates.

Keywords

Debulking; Ear keloid treatment; Keloid; Patient satisfaction; Recurrence; Triamcinolone acetonide.

Abstract

الخلفية: تمثل الجدرات (الكيلويد) في الأذن تحديًا سريريًا كبيرًا، حيث يرتبط الإستئصال الجراحي وحده بمعدلات إنتكاسة عالية (45%-100%). تم إكتشاف علاجات مساعدة مختلفة لتحسين النتائج، مع ظهور نتائج واعدة لحقن الستيرويدات داخل الآفة.
الهدف: تقييم فعالية وسلامة العلاج بالتخفيف مع حقن تريامسينولون أسيتونيد داخل الآفة مقارنةً بالتخفيف وحده في علاج جدرات شحمة الأذن واللولب.
المنهجية: أُجريت هذه الدراسة في قسم الأمراض الجلدية والتناسلية في مستشفى بغداد التعليمي من كانون الثاني 2014 إلى تشرين الأول 2015. شملت الدراسة 28 مريضة يعانين من 67 آفة جدرية ناتجة عن ثقب الأذن، تم تقسيمهن عشوائيًا إلى مجموعتين: المجموعة الأولى خضعت للتخفيف متبوعًا بحقن تريامسينولون أسيتونيد (0.25 ملغ إلى 1 ملغ) داخل الآفة، بينما تلقت المجموعة الثانية التخفيف فقط. تم تقييم الإستجابة للعلاج على مدى ستة أشهر باستخدام قياسات إرتفاع الجدرة، ومقياس التناظر البصري (VAS) للتحسن، ودرجات رضا المريض، ومعدلات الإنتكاسة.
النتائج: أظهرت المجموعة الأولى تحسنًا أكبر، حيث بلغ متوسط درجة الـ VAS 8.8 ± 2.00 مقارنةً بـ 2.63± 3.5 في المجموعة الثانية. كما كان رضا المرضى أعلى في المجموعة الأولى (8.6 ± 2.38) مقارنةً بالمجموعة الثانية (3.5 ± 2.40). كان معدل الانتكاسة أقل بشكل ملحوظ في المجموعة الأولى (13.3%) مقارنةً بالمجموعة الثانية. (92.3%) لم تُلاحظ أي آثار جانبية كبيرة أو تأثيرات ضارة جهازية في أي من المجموعتين.
الإستنتاج: يعد الجمع بين التخفيف وحقن تريامسينولون أسيتونيد داخل الآفة علاجًا أكثر فعالية لجدرات شحمة الأذن واللولب مقارنةً بالتخفيف وحده. هذه الطريقة بسيطة ومنخفضة التكلفة وجيدة التحمل، وتؤدي إلى رضا أعلى للمرضى وانخفاض كبير في معدلات الانتكاسة.

Keywords

التخفيف، علاج جدرة الأذن، الجدرة، رضا المريض، الانتكاسة، تريامسينولون أسيتونيد.

5

Radiological Patterns of Bronchogenic Carcinoma in a Sample of Iraqi Patients

Haidar N. Dawood, Mohammed I. Sameen, Mudher Al-Khairalla

Pages: 288-293 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Bronchogenic carcinoma considered as one of the most common malignant diseases that affects both sexes. The radiological profile of bronchogenic cancer can prove to be of great assistance in a management of this disease.
Objectives: The current study aimed to assess a radiological profile for bronchogenic carcinoma in a sample of Iraqi patients.
Methods: A cross sectional study that comprised a total of 100 patients affected with bronchogenic cancer in Al-Imamain Al-Kadhimain Medical City, Baghdad, Iraq, from the 1st of January to 31st of July 2020. Clinical characteristics, diagnostic modalities, the site of the tumor within the lung, radiological findings, and the histopathologic type of cancer, were recorded.
Results: The subjects consisted of 100 patients affected with bronchogenic carcinoma, 70% are males and 30% are females, the mean age was 62.26±10.8 years. Also, 59% were ex\current smokers. Site of the tumor according to CT scan was 44% in the left lung, 40% in the right lung, and 16% bilaterally. The most common histopathological type was squamous cell carcinoma, accounting for 44% of patients; the second type is adenocarcinoma (39%). The radiological findings showed 53% of the cases, the cancer was seen as a mass on imaging, while in 35% a solitary nodule was found
Conclusions: Lung mass and lung nodules are the most common radiological findings in bronchogenic carcinoma. There was no significant association between the radiological finding, site of lesion, and histopathological type.

Keywords

Bronchogenic carcinoma; Chest imaging; Computed Tomography; Iraqi patients radiological Patterns

Abstract

خلفية الدراسة: سرطان الشعب الهوائية هو واحد من الأمراض الأكثر شيوعا في كل من الذكور والإناث. يمكن أن يساعد المظهر الإشعاعي لسرطان القصبات الهوائية في إدارة المرض.
الهدف من البحث: تقييم الملامح الشعاعية لسرطان الشعب الهوائية في عينة من المرضى العراقيين.
طرائق العمل: شملت هذه الدراسة المقطعية تشمل ما مجموعه 100 مريض بسرطان الشعب الهوائية. تم تسجيل الخصائص السريرية للمريض ، بما في ذلك العمر والجنس وحالة التدخين والاعراض السريرية وطرق التشخيص وموقع الورم داخل الرئة والنتائج الإشعاعية والنوع النسيجي المرضي
النتائج: 100 مريض مصاب بسرطان الشعب الهوائية، 70% ذكور و30% إناث، متوسط العمر 62.26 سنة. 59% كانوا مدخنين حاليين او سابقين. 44% في الرئة اليسرى، 40% في الرئة اليمنى و16% في الرئتين . كان سرطان الخلايا الحرشفية
هو النوع النسيجي المرضي الأكثر شيوعًا حيث يمثل 44٪ من المرضى، يليه السرطان الغدي (39٪). أظهرت النتائج الإشعاعية أن 53% من المرضى لديهم كتلة و35% لديهم عقيدات. لم يكن هناك ارتباط كبير بين النتائج الشعاعية والنوع النسيجي المرضي. كما لم يكن هناك ارتباط احصائي مهم بين موقع المرض في الرئة ونوع الأنسجة المرضية.
الاستنتاجات: وجود كتلة في الرئة وعقيدات الرئة هي النتائج الإشعاعية الأكثر شيوعا في سرطان اشعب الهوائية، ولم يكن هناك ارتباط احصائي كبير بين النتائج الإشعاعية وموقع موقع المرض في الرئة ونوع الأنسجة المرضية

Keywords

: الانماط الشعاعية التصوير المقطعي المحوسب المرضى العراقيين تصوير الصدر سرطان القصبات

6

Comparison of the effects of intra-articular injection of Hyaluronic Acid Versus Methyl Prednisolone Acetate in a Group of Iraqi Patients with Knee Osteoarthritis: A Double-Blind Controlled Study

Mohammed J. Ibraheem, محمد عبدالحسن جبارة, سامي التكريتي

Pages: 302-308

Issues

7

The Role of Kisspeptin in Intracytoplasmic Sperm Injection Cycles in a Group of Infertile Iraqi Females

Hiba R. Qassim, Najeeb H. Mohammed

Pages: 309-314 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Infertility is a global issue that not only affects individuals but also impacts society as a whole. Kisspeptin has emerged as a key player in the understanding of certain facets of infertility. However, research on the role of kisspeptin in fertility, particularly in assisted reproductive treatment, remains limited.
Objectives: To investigate the potential association between follicular fluid kisspeptin levels and various reproductive parameters, including the number and maturity of oocytes, fertilization rate, pregnancy detection, anti-Müllerian hormone levels, and the age of females.
Methods: Sixty infertile couples with an age range of 20 – 40 years participated in this study. They complained of unexplained infertility, had no hormonal or male factors, all with the same stimulation protocol, with follicular fluid collected on the day the oocytes were retrieved. These follicular fluid samples were centrifuged and then frozen at -20ºC until the day an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for kisspeptin was done. The study was conducted at the High Institute for Infertility Diagnosis and Assisted Reproductive Technology, Al-Nahrain University, Baghdad, between the 1st of January to the 1st of July, 2023.
Results: A significant negative correlation was found between follicular kisspeptin levels and female age. Kisspeptin levels positively correlated with the number of retrieved oocytes, mature oocytes, fertilized oocytes, and AMH levels. Higher kisspeptin levels were observed in pregnant women (707.7 ± 235.28 pg/mL) than in non-pregnant ones (648.9 ± 215.27 pg/mL), but the difference was not significant. A strong positive correlation was found between follicular and serum kisspeptin.
Conclusion: This study suggested that kisspeptin may play a key role in ovarian function, as its levels were associated with oocyte quality and ovarian reserve. The observed relationship between kisspeptin levels and both female age and reproductive outcomes highlights its potential as a biomarker in assisted reproduction.

Keywords

Kisspeptin; Follicular Fluid; Fertilization; Oocytes; Ovarian Follicle

Abstract

الخلفية: يُعد العقم مشكلة عالمية لا تؤثر على الأفراد فحسب، بل تؤثر أيضًا على المجتمع ككل. وقد برز الكيسبيبتين كعامل رئيسي في فهم جوانب معينة من العقم. ومع ذلك، لا تزال الأبحاث حول دور الكيسبيبتين في الخصوبة، وخاصةً في علاجات الإنجاب المساعد، محدودة.
الأهداف: دراسة العلاقة المحتملة بين مستويات الكيسبيبتين في السائل الجريبي ومختلف المعايير التناسلية، بما في ذلك عدد البويضات ونضجها، ومعدل الإخصاب، واكتشاف الحمل، ومستويات الهرمون المضاد لمولر، وعمر الإناث.
المنهجية: شارك في هذه الدراسة ستون زوجًا يعانون من العقم، تتراوح أعمارهم بين ٢٠ و٤٠ عامًا. اشتكوا من عقم غير مبرر، ولم تكن لديهم أي عوامل هرمونية أو ذكورية، وجميعهم اتبعوا بروتوكول التحفيز نفسه، حيث جُمعت عينات من السائل الجريبي في يوم سحب البويضات. طُردت هذه العينات بالطرد المركزي، ثم جُمدت عند درجة حرارة -٢٠ درجة مئوية حتى تاريخ إجراء اختبار الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم (ELISA) للكشف عن هرمون الكيسبيبتين. أُجريت الدراسة في المعهد العالي لتشخيص العقم وتقنيات الإنجاب المساعدة، جامعة النهرين، بغداد، في الفترة من ١ يناير إلى ١ يوليو ٢٠٢٣.
النتائج: وُجد ارتباط سلبي كبير بين مستويات الكيسبيبتين الجريبي وعمر الأنثى. وارتبطت مستويات الكيسبيبتين ارتباطًا إيجابيًا بعدد البويضات المسترجعة، والبويضات الناضجة، والبويضات المخصبة، ومستويات AMH. ولوحظت مستويات الكيسبيبتين أعلى لدى النساء الحوامل (707.7 ± 235.28 بيكوغرام/مل) مقارنةً بغير الحوامل (648.9 ± 215.27 بيكوغرام/مل)، إلا أن الفرق لم يكن ذا دلالة إحصائية. وُجد ارتباط إيجابي قوي بين الكيسبيبتين الجريبي والمصلي.
الإستنتاج: تشير هذه الدراسة إلى أن الكيسبيبتين قد يلعب دورًا رئيسيًا في وظيفة المبيض، إذ ارتبطت مستوياته بجودة البويضات واحتياطي المبيض. وتُبرز العلاقة الملحوظة بين مستويات الكيسبيبتين وعمر الأنثى ونتائجها الإنجابية إمكاناته كمؤشر حيوي في الإنجاب المساعد.

Keywords

كيسبيبتين، السائل الجريبي، الإخصاب، البويضات، الجريبات المبيضية

8

Vitamin D and the Pathogenesis of Primary Hypothyroidism

Abbas S. Jebur, Basil O. Saleh, Omar F. Al Azzawi

Pages: 315-321 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Vitamin D deficiency is a risk factor for neuropsychiatric disorders and autoimmune diseases.
Objectives: This study aimed to investigate the relationship between vitamin D and the pathogenesis of primary hypothyroidism.
Methods: A case-control study was conducted at the Department of Biochemistry, College of Medicine, University of Baghdad, and Endocrinology and Diabetes Clinic. The study involved 81 patients aged 29-62 years, with 24 newly diagnosed hypothyroidism, 33 had established hypothyroidism, and 24 had subclinical hypothyroidism. The control group consisted of 40 healthy individuals aged 29-62 years. The study used the MAGLUMI® 800 analyzer Chemiluminescence Immunoassay System, which uses Acridinium Ester-based Immunoassay technology for high sensitivity and specificity (True Negative Rate). Thyroid peroxidase antibodies and 25- hydroxyvitamin D were also tested using the Enzyme-Linked Immunosorbent Assay technique.
Results: The results revealed that the median and 1st -3rd quartile range values of serum 25 hydroxyvitamin D levels of newly diagnosed, established, and subclinical primary hypothyroidism were significantly decreased compared to controls (for all, p<0.0001). However, there were non-significant differences between newly diagnosed and subclinical, newly diagnosed and established, and between subclinical and established. There was a significant negative correlation between 25-hydroxyvitamin D and thyroid stimulating hormone in newly diagnosed and significant positive correlation in subclinical. Also, there were significant positive correlations between 25-hydroxyvitamin D and freeT4 in established and subclinical.
Conclusion: Vitamin D deficiency may play an important role in the pathogenesis of primary hypothyroidism, whether it is a newly diagnosed, established, or subclinical one.

Keywords

25(OH) D; Hypothyroidism; Immunoassay; Serum TSH; Subclinical.

Abstract

خلفية البحث: نقص فيتامين د هو عامل خطر للاضطرابات العصبية والنفسية وأمراض المناعة الذاتية.
الاهداف :صُممت هذه الدراسة لدراسة العلاقة بين فيتامين د ومرض قصور الغدة الدرقية الأولي.
المرضى وطرائق العمل:أجريت دراسة الحالات والشواهد في قسم الكيمياء الحيوية بكلية الطب بجامعة بغداد وعيادة الغدد الصماء والسكري. شملت الدراسة 81 مريضًا تتراوح أعمارهم بين 29 و 62 عامًا، منهم 24 مصابًا بقصور الغدة الدرقية حديث التشخيص، و 33 مصابًا بقصور الغدة الدرقية الصريح، و 24 مصابًا بقصور الغدة الدرقية دون السريري. تتكون المجموعة الضابطة من 40 فردًا سليمًا تتراوح أعمارهم بين 29 و 62 عامًا. استخدمت الدراسة نظام التحليل المناعي الكيميائي الضوئي MAGLUMI® 800 (CLIA)، والذي يستخدم تقنية التحليل المناعي القائم على إستر الأكريدينيوم (ABEI) للحساسية العالية والخصوصية.
النتائج:وجدت الدراسة أن مستويات فيتامين د3 انخفضت بشكل ملحوظ في مرضى قصور الغدة الدرقية الأولي الذين تم تشخيصهم حديثًا والمُثبت وغير السريري مقارنةً بالاصحاء . كان هناك ارتباط سلبي كبير بين 25-هيدروكسي فيتامين د وTSH في قصور الغدة الدرقية الأولي المُكتشف حديثًا وقصور الغدة الدرقية الأولي دون السريري. أيضًا، كانت هناك ارتباطات إيجابية كبيرة بين 25-هيدروكسي فيتامين د وfT4 في قصور الغدة الدرقية الأولي المُثبت وقصور الغدة الدرقية الأولي دون السريري.
الاستنتاجات: تم توثيق مستويات فيتامين د المنخفضة بشكل ملحوظ في المرضى الذين يعانون من قصور الغدة الدرقية الأولي. ترافقت الأجسام المضادة للغدة الدرقية ووظائف الغدة الدرقية غير الطبيعية مع نقص فيتامين د.

Keywords

25(OH) D،التحليل المناعي تحت سريري قصور الغدة الدرقية، هرمون تحفيز الغدة الدرقية في المصل.

9

Detection of Class 1 Integron among Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates in Baghdad Hospitals

Pages: 384-394 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Extensively drug-resistant Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) is a significant problem currently due to the increasing prevalence of this pathogen. Objectives: To underscore the growing threat of antibiotic-resistant K.pneumoniaeby investigating the prevalence of class 1 integrons among selected multidrug-resistant (MDR) clinical isolates, with the goal of emphasizing the need for strengthened surveillance and targeted antimicrobial strategies.Methods:Seventy-four K. pneumoniae isolateshave been identified out of 200 clinical samples from different clinical sources (urine, burns, blood, sputum,wounds). Isolates were obtainedfrom November 2024 to March 2025, in Al-Kadhimiya Teaching Hospital and the Laboratory at College of Science Microbiology Department, University of Baghdad. The isolates were first detected by biochemical testing, chromogenic agarand later confirmed using the VITEK 2 method. Antimicrobial susceptibility was evaluated using the disc diffusion technique (Kirby-Bauer method). The presence of the class 1 integron gene was confirmed via conventional PCR.
Results: A total of 200 clinical samples were the 74 K. pneumoniae isolates;51 (68.9%) exhibited multidrug resistance. Resistance to cefotaxime was observed in 86%, followed by tetracycline (80%), while imipenem exhibited the highest sensitivity at 84%. Class 1 integron gene was identified in 80% of the 10 selected multidrug-resistant isolates.
Conclusion: The high incidence of class 1 integrons in multidrug-resistant K. pneumoniae clinical isolates highlights the essential role of integrons in the spread of antibiotic resistance. This indicates the worldwide emergence of K. pneumoniae pathogenic strains resistant to colistin and carbapenems, highlighting the imperative for ongoing molecular surveillance and efficient antibiotic stewardship

10

Proenkephalin-A as a Biomarker for Type 2 Diabetes in Women with Thyroid Disorders

Maryam A. Hassoun, Eiman AA. Abass

Pages: 395-402 English

Full Text Issues

Abstract

Background: The thyroid is a vital endocrine gland that regulates growth, metabolism, and development. Thyroid dysfunction (TD) and diabetes mellitus (DM) are two prevalent endocrine disorders with overlapping pathophysiological features.
Objective: To investigate the potential role of proenkephalin-A (PENK-A) as a diagnostic and predictive biomarker for type 2 diabetes in women with thyroid dysfunction.Methods:A total of 130 women aged 25–55 years were enrolled in the study, including 100 patients with thyroid disorders and 30 healthy controls. The study was conducted from December 2024 to April 2025 at Al-Kindy Centre for Endocrinology and Diabetes in Baghdad. Participants were categorised into four subgroups based on the presence or absence of hypothyroidism, hyperthyroidism, and DM. Serum levels of PENK-A, TSH, T3, T4, and HbA1c were measured using different principles of the ELISA technique, while (FBG) Fasting Blood Glucose was determined by the enzymatic colourimetric method using a glucose kit from Randox.To express the data, the mean ±SD was used.
Results: PENK-A levels were significantly elevated in patients with both thyroid dysfunction and type 2 diabetes compared to non-diabetic patients and controls. PENK-A demonstrated high diagnostic performance in distinguishing hypothyroidism and hyperthyroidism patients with DM from those without DM, achieving an outstanding AUC of 0.942 and 0.813, respectively.
Conclusions: Proenkephalin-A may serve as a sensitive and specific biomarker for predicting and monitoring type 2 diabetes in patients with thyroid disorders

11

Evaluation of the Antibacterial and Anti-iofilm Impact of Fenugreek (Trigonella foenum-graecum L.) Seed Extracts against some Antibiotic-Resistant Pathogenic Bacteria

Zahraa A. Zamil, Huda S. A. AL-Hayanni1

Pages: 322-329 English

Full Text Issues

Abstract

Background: The prevalence of multidrug-resistant bacteria has demonstrated a need to develop and use alternative antimicrobial agents. There has been a growing interest in medicinal plants and herbs and their extracts.
Objective: To identify the antibacterial and anti-biofilm activity of aqueous and alcoholic extracts of the Fenugreek (Trigonella foenum-graecum L.) seed against multidrug-resistant clinical bacterial isolates (Gram-positive Staphylococcus aureus and Gram-negative Acinetobacter baumannii).
Methods: Aqueous and alcoholic extracts were prepared from the seeds of the Fenugreek (Trigonella foenum-graecum L.) plant. A gas chromatography-mass spectrometer was used to identify the active compounds in the extracts. They were tested against multidrug-resistant bacterial isolates that produce biofilms (Gram-positive and Gram-negative), namely Staphylococcus aureus and Acinetobacter baumannii, which were isolated from Iraqi patients in Baghdad Medical City Hospitals (including Burns Specialized Hospital, Baghdad Teaching Hospital, and Al-Shahid Ghazi Al-Hariri Hospital for Surgical Specialties), Al Kadimyia Teaching Hospital, and Al-Kindy Teaching Hospital, from October 2023 to March 2024.
Result: The current study has proved that the aqueous and alcoholic extracts of Fenugreek seeds were effective as antibacterial and anti-biofilm against the studied bacterial isolates, in all the tested concentrations, with significant differences. The study also showed that the aqueous extract of Fenugreek was more effective as an anti-bacterial and anti-biofilm than the alcoholic extract. The aqueous extract demonstrated high inhibitory activity, ranging from 52.9% to 97.5%, while the inhibition of the alcoholic extract varied from 56.0% to 99.5%.
Conclusion: The present study supports the use of fenugreek seed extract to treat pathogenic bacteria that have developed a resistance to antibiotics.

Keywords

Acinetobacter baumannii; Antibacterial activity; Anti-biofilm impact; Multidrug-resistant bacteria; Staphylococcus aureus; Trigonella foenum-graecum L.

Abstract

الخلفية: أظهرت الزيادة في انتشار البكتيريا المقاومة للأدوية المتعددة الحاجة إلى تطوير واستخدام عوامل بديلة مضادة للميكروبات. وقد ازداد الاهتمام مؤخرًا بالنباتات الطبية والأعشاب ومستخلصاتها.
الهدف: تقييم الفعالية المضادة للبكتيريا والأغشية الحيوية للمستخلصات المائية والكحولية لبذور الحلبة (Trigonella foenum-graecum L.) ضد عزلات بكتيرية سريرية مقاومة للعديد من الأدوية (المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus الموجبة لصبغة غرام، والراكدة البومانية Acinetobacter baumanniiالسالبة لصبغة غرام).
المنهجية: تم اختيار نبات الحلبة (Trigonella foenum-graecum L.) لهذه الدراسة، حيث تم تحضير مستخلصين مائي وكحولي من بذوره. واستخدم جهاز كروماتوغرافيا الغاز المقترن بمطياف الكتلة (GC-MS) لتحديد المركبات الفعالة في هذه المستخلصات. تم اختبار فعالية المستخلصات ضد العزلات البكتيرية المقاومة للأدوية المتعددة والمكوِّنة للأغشية الحيوية (موجبة وسالبة لصبغة غرام)، وهي المكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus والراكدة البومانية Acinetobacter baumannii، والتي تم عزلها من مرضى عراقيين في مستشفيات بغداد.
النتائج: أظهرت الدراسة الحالية أن المستخلصين المائي والكحولي لبذور الحلبة لهما فعالية مضادة للبكتيريا ومضادة للأغشية الحيوية ضد العزلات البكتيرية المدروسة بجميع التراكيز المستخدمة، مع فروق معنوية ملحوظة. كما بينت الدراسة أن المستخلص المائي كان أكثر فعالية كمضاد للبكتيريا ومضاد للأغشية الحيوية مقارنة بالمستخلص الكحولي. وأظهر المستخلص المائي نشاطًا مثبطًا عاليًا تراوح بين 52.9% و97.5%، بينما تراوح تثبيط المستخلص الكحولي من 56.0% إلى 99.5%.
الاستنتاج: توفر هذه الدراسة نتائج واعدة تدعم استخدام مستخلصات الحلبة، في معالجة البكتيريا الممرضة المقاومة للمضادات الحيوية، حيث تحتوي هذه المستخلصات على مركبات طبيعية يمكن استخدامها، كما تم إثباته بواسطة تحليل جهاز كروماتوغرافيا الغاز- مطياف الكتلة (GC-MS

Keywords

الراكدة البومانية، فعالية مضادة للبكتيريا، مقاومة متعددة للأدوية، المكورات العنقودية الذهبية، الحلبة (Trigonella foenum-graecum L.)

12

Characterization of VirulenceFactors and Two-Component Regulatory System Genes in Uropathogenic Escherichia coliIsolates from Young Women with Urinary Tract Infections

Pages: 368-377

Full Text Issues

Abstract

Escherichia coli. Uropathogenic Escherichia coli(UPEC)possess virulence factors that can worsen infections, partly regulated by the BarA/UvrYtwo-component system, which controls genes associated with adhesion, motility, and biofilm formation through small RNAs and carbon metabolism regulators.Objectives: To determine the pathogenicity and some genotype features of Escherichia colifrom urine specimens collected from young womenpatientsand assess their antibiotic resistance.Methods:Between September and November 2024, 200urine samples were collected from young women aged 18 to 30 who had urinary tract infections, from a number of major hospitals in Baghdad. Identification of bacteria was confirmed using differential and chromogenic media, followed by biochemical confirmation with the VITEK 2 Compact System. Antimicrobial susceptibility was tested using the VITEK 2 Compact System. The ability of Escherichia colito form biofilm, swarm, and produce hemolysin was evaluated. Conventional PCR methods were used to detect the prevalence of the two-component system genes in Escherichia coli.Results: The isolation rate of Escherichia colifrom urine samples was 44.5%,yielding 89 isolates. High resistance to cefotaxime (82.5%) was observed, while all isolateswere fully sensitive to meropenem, amikacin, and tigecycline.A substantial 85% of isolates produced β-lactamase, and 2.5% displayed both β-lactamase production and polypeptide resistance mechanisms. Production of hemolysin was seen in 48.3% of isolates,while 34.8% showed swarming motility. Biofilm formation varied, with 13.4% being moderate producers, 29% being weak producers, and 57.3% not producing. Genotypic analysis of 16 representative isolates revealed the presence of the BarA and UvrY genes.
Conclusion: This study highlighted the critical role of UPEC in urinary tract infections among young women, marked by significant cefotaxime resistance. Despite the uniform presence of the BarA and UvrY genes, isolates displayed diverse virulence profiles, underscoring the complex interplay between resistance and pathogenicity

13

The Role of p27kip1 in the Aggressiveness of Papillary Thyroid Carcinoma: A Clinicopathological Analysis

Pages: 351-358

Full Text Issues

Abstract

Background:Cell-cycle-regulating proteins, including cyclin-dependent kinase inhibitor1Bp27kip1,have been researched in different malignancies, including thyroid carcinoma, and their association with tumor aggressiveness and recurrence has been examined in many tumors.Objective:This research aimed to examine the clinicopathological relevance of reduced cyclin-dependent kinase inhibitor 1Bp27kip1expression in papillary thyroid carcinomaand its association with the clinicopathological parameters indicative of papillary thyroid carcinomaaggressiveness.Methods: Formalin-fixed, paraffin-embedded tissue blocks were obtained from histologically confirmed cases of papillary thyroid carcinoma diagnosed between June 2022 and June 2023 at the National Center for TeachingLaboratories, Medical City Complex,Baghdad, Iraq. A total of 60papillary thyroid carcinoma sampleswere included in the study. Immunohistochemical analysis was performed to assess the expression of the p27protein. The study further evaluated the association between cyclin-dependent kinase inhibitor 1Bp27kip1expression and various clinicopathological parameters, including patients’age, sex, papillary thyroid carcinomasubtypes, tumor size, capsular invasion, multifocality, extrathyroidal extension, and lymph node metastasis.Results: A decrease in the expression of cyclin-dependent kinase inhibitor 1B p27kip1of less than 10%was observed in 37 out of 60 cases (61.7%).The correlation with clinicopathological parameters revealed a significant decrease in expression ofcyclin-dependent kinase inhibitor 1Bp27kip1associated with femalesex, classical variant PTC, infiltrative tumors, large tumor size(2-2.5 cm), and multifocal lesions.Conclusion:Reduced expression ofcyclin-dependent kinase inhibitor 1Bp27kip1;(<10%) was observed ata relatively highrate in papillary thyroid carcinoma. Asignificant correlationwas found between decreasedcyclin-dependent kinase inhibitor 1B p27kip1expression and several clinicopathological features, including infiltrativepattern tumors, large tumor size, and multifocality. These findings suggest that reduced cyclin-dependent kinase inhibitor 1B p27kip1expression may be linked to more aggressive tumor behaviourand could potentially serve as a prognostic marker in PTC

14

Assessment of Malondialdehyde as a Biomarker of Oxidative Stress and Its Correlation with 25-hydroxy Vitamin D3 in Women with Polycystic Ovary Syndrome

Mohammed N. Qasim, Halla G. Mahmood

Pages: 330-337 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) is a prevalent endocrinology disorder affecting women in the years of reproduction. Malondialdehyde (MDA) is a result of polyunsaturated fatty acid peroxidation and is widely utilized as a trustworthy indicator of peroxidation of lipids and oxidative damage. Conversely, Vitamin D deficiency is a global issue affecting around one billion individuals. 25-hydroxyvitamin D₃ is linked to multiple metabolic processes and reproduction facets of women with PCOS and thus may contribute to the PCOS pathophysiology.
Objectives: To measure and compare serum malondialdehyde levels and 25-hydroxyvitamin D₃ concentrations between women with polycystic ovary syndrome (PCOS) versus age-matched healthy controls and to investigate the correlation between malondialdehyde and 25-hydroxyvitamin D₃ levels in both groups to elucidate potential mechanistic links between oxidative stress and vitamin D deficiency in PCOS pathophysiology.
Methods: The present case-control research was conducted at the Infertility Centre of Al-Batool Teaching Hospital, Diyala Governorate, Iraq, in collaboration with the Biochemistry Department at the College of Medicine, University of Baghdad, from April 2024 to January 2025. A total of 132 women aged 18-40 years were included in this study, comprising 66 PCOS cases and 66 healthy controls. A competitive enzyme-linked immunosorbent assay assessed the concentrations of serum malondialdehyde and 25-hydroxy vitamin D3.
Results: The results indicated markedly elevated serum malondialdehyde concentrations within the PCOS group compared to the controls. The concentrations of 25-hydroxy vitamin D3 in the PCOS group were considerably reduced compared to the controls. A significant negative correlation was found between serum malondialdehyde levels and 25-hydroxy vitamin D3 in the PCOS Group.
Conclusion: The current study showed that PCOS cases had much higher MDA levels than controls, probably indicating that they have experienced more oxidative stress. The level of 25(OH)D showed a common lack of this vitamin in the PCOS cases.

Keywords

Body Mass Index; Malondialdehyde; Oxidative Stress; Polycystic Ovary Syndrome; Vitamin D3 Deficiency

Abstract

الخلفية: تُمثل متلازمة تكيس المبايض اضطرابًا غدديًا صماء شائعًا يصيب النساء في مرحلة الإنجاب. يُنتج المالونديالدهيد نتيجة أكسدة الأحماض الدهنية المتعددة غير المشبعة، ويُستخدم على نطاق واسع كمؤشر موثوق لأكسدة الدهون والضرر التأكسدي. من ناحية أخرى، يُعد نقص فيتامين د مشكلة عالمية تُصيب حوالي مليار شخص. يرتبط فيتامين د بالعديد من العمليات الأيضية والجوانب التناسلية لدى النساء المصابات بمتلازمة تكيس المبايض، وبالتالي قد يُسهم في الفيزيولوجيا المرضية لمتلازمة تكيس المبايض.
الأهداف: قياس ومقارنة مستويات المالونديالدهيد في مصل الدم وتركيزات 25-هيدروكسي فيتامين د3 لدى النساء المصابات بمتلازمة تكيس المبايض مع مجموعة من النساء الأصحاء المتطابقات في العمر. وبحث في العلاقة بين مستويات المالونديالدهيد و25-هيدروكسي فيتامين د3 في كلا المجموعتين لتوضيح الروابط الميكانيكية المحتملة بين الإجهاد التأكسدي ونقص فيتامين د في الفسيولوجيا المرضية لمتلازمة تكيس المبايض.
المنهجية: أجريت دراسة الحالات والشواهد الحالية في مركز العقم بمستشفى البتول التعليمي في محافظة ديالى بالعراق، مع قسم الكيمياء الحيوية بكلية الطب جامعة بغداد، من نيسان 2024 إلى كانون الثاني 2025. شملت هذه الدراسة ما مجموعه 132 إمرأة تتراوح أعمارهن بين 18 و40 عامًا، تضمّنت 66 حالة مصابة بمتلازمة تكيس المبايض، و66 امرأة سليمة كمجموعة ضابطة. وقد قُيِّم تركيز مالونديالدهيد و25-هيدروكسي فيتامين د3 في المصل باستخدام اختبار الممتز المناعي المرتبط بالإنزيم التنافسي.
النتائج: أشارت نتائج البحث إلى ارتفاع ملحوظ في تركيزات مالونديالدهيد في مصل الدم لدى مجموعة متلازمة تكيس المبايض مقارنةً بالمجموعة الضابطة. انخفضت تركيزات و25-هيدروكسي فيتامين د3 داخل مجموعة متلازمة تكيس المبايض بشكل كبير مقارنة بتلك الموجودة في المجموعة غير المصابة بمتلازمة تكيس المبايض، مما كشف عن وجود ارتباط سلبي كبير بين مستويات مالونديالدهيد في المصل و25-هيدروكسي فيتامين د3 (r =- 0.699، P <0.0001) في مجموعة متلازمة تكيس المبايض.
الاستنتاج: تظهر الدراسة الحالية أن حالات متلازمة تكيس المبايض كان لديها مستويات مالونديالدهيد أعلى بكثير من العينة الضابطة، مما يشير على الأرجح إلى تعرضهن لمزيد من الإجهاد التأكسدي. تظهر مستويات فيتامين د نقصًا شائعًا في هذا الفيتامين في حالات متلازمة تكيس المبايض.

Keywords

مؤشر كتلة الجسم؛ مالونديالدهيد؛ الإجهاد التأكسدي؛ متلازمة تكيس المبايض؛ نقص فيتامين د3.

15

Evaluation of Metanephrine and Lactate Dehydrogenase in Pediatric Wilms Tumor and Neuroblastoma

Nihad A. Jwda, Manal K.Rasheed, Hasanein H. Ghali

Pages: 338-343 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Wilms' tumor and Neuroblastoma are common pediatric malignancies, with biochemical markers like plasma metanephrines and serum lactate dehydrogenase (LDH) being studied for diagnostic and prognostic values. Metanephrine, a catecholamine metabolite, is elevated in Neuroblastoma due to tumor secretion. Elevated LDH levels may correlate with tumor burden and indirectly indicate disease activity.
Objectives: To evaluate plasma metanephrine and lactate dehydrogenase as biomarkers in Neuroblastoma and Wilms tumor in pediatric patients.
Methods: The study was conducted between February and December 2024, in the Children Welfare Teaching Hospital, Medical City Complex, Baghdad, Iraq, and the Department of Biochemistry, College of Medicine, University of Baghdad. A Total of 98 children under the age of 10 years were included and grouped into: Group 1: 34 patients with Neuroblastoma, Group 2: 31 patients with Wilms tumor, and Group 3: 33 healthy children serving as controls. Blood samples (5 mL) were collected from all participants. Plasma metanephrine levels were measured using an ELISA method, while lactate dehydrogenase levels were determined using the Roche Cobas analyzer. Anthropometric parameters were also measured.
Results: The study found no significant differences in age, weight, or height among Neuroblastoma, Wilms tumor, and control groups. However, Neuroblastoma patients showed significantly higher Metanephrine levels (26.2 ± 2.24 ng/mL) compared to Wilms tumor (8.0 ± 0.28 ng/mL) and controls (7.5 ± 0.29 ng/mL). Similarly, LDH levels were elevated in Neuroblastoma (848.8 ± 87.57 U/L) and Wilms tumor (629.3 ± 66.99 U/L) versus controls (68.6 ± 3.90 U/L), with Neuroblastoma exhibiting higher LDH than Wilms tumor.
Conclusion: The study emphasizes the importance of using metanephrine measurements for Neuroblastoma diagnosis and monitoring, as these metabolites can inform treatment response and disease progression. Neuroblastoma exhibits higher levels of metanephrine and lactate dehydrogenase, indicating a larger tumor burden. Wilms tumor does not share these characteristics

Keywords

Lactate Dehydrogenase Metanephrine neuroblastoma Pediatric cancer Wilms tumor

Abstract

الخلفية: ورم ويلمز والورم الأرومي العصبي هما من الأورام الخبيثة الشائعة لدى الأطفال. تمت دراسة العلامات البيوكيميائية مثل الميتانفرينات في البلازما ونازعة هيدروجين اللاكتات (LDH) في المصل لقيمها التشخيصية والتنبؤية. الميتانفرين، وهو أحد نواتج استقلاب الكاتيكولامينات، يرتفع بشكل خاص في الورم الأرومي العصبي بسبب إفراز الورم للكاتيكولامينات. قد ترتبط مستويات LDH المرتفعة، على الرغم من أنها غير محددة، بعبء الورم في كل من ورم ويلمز والورم الأرومي العصبي، مما يعمل كعلامة غير مباشرة لنشاط المرض.
الأهداف: لتقييم الميتانفرين في البلازما ونازعة هيدروجين اللاكتات كمؤشرات حيوية في الورم الأرومي العصبي وورم ويلمز لدى مرضى الأطفال.
المنهجية: أُجريت الدراسة بين فبراير وديسمبر 2024 في مستشفى تعليمي حماية الطفل في المدينة الطبية ببغداد، العراق، وقسم الكيمياء الحيوية/ كلية الطب/ جامعة بغداد، على 98 طفلاً دون سن 10 عامًا، تم تقسيمهم إلى: المجموعة الأولى: 34 مريضًا بورم الأرومة العصبية، المجموعة الثانية: 31 مريضًا بورم ويلمز، والمجموعة الثالثة: 33 طفلاً سليمًا يعملون كمجموعة تحكم. تم جمع عينات دم (5 مل) من جميع المشاركين. تم قياس مستويات الميتانفرين في البلازما باستخدام طريقةELISA، بينما تم تحديد مستويات نازعة هيدروجين اللاكتات باستخدام محلل Roche Cobas كما تم قياس المعايير الأنثروبومترية.
النتائج: لم تجد الدراسة فروقًا ذات دلالة إحصائية في العمر أو الوزن أو الطول بين مجموعات الورم الأرومي العصبي، وورم ويلمز، ومجموعة التحكم. ومع ذلك، أظهر مرضى الورم الأرومي العصبي مستويات ميتانفرين أعلى بكثير (26.2 ± 2.24 نانوجرام/مل) مقارنة بورم ويلمز (8.0 ± 0.28 نانوجرام/مل) والمجموعات الضابطة (7.5 ± 0.29 نانوجرام/مل). وبالمثل، كانت مستويات LDH مرتفعة في الورم الأرومي العصبي (848.8 ± 87.57 وحدة/لتر) وورم ويلمز (629.3 ± 66.99 وحدة/لتر) مقارنة بالضوابط (68.6 ± 3.90 وحدة/لتر) حيث أظهر الورم الأرومي العصبي LDH أعلى من ورم ويلمز. تسلط هذه النتائج الضوء على الميتانفرين و LDH كمؤشرات حيوية رئيسية للتمييز بين الورم الأرومي العصبي والمجموعات الأخرى.
الاستنتاجات: تؤكد الدراسة على أهمية استخدام قياسات الميتافرين لتشخيص ومراقبة الورم الأرومي العصبي، حيث يمكن لهذه المستقلبات أن تقدم معلومات حول الاستجابة للعلاج وتطور المرض. يُظهر الورم الأرومي العصبي مستويات أعلى من الميتانفرين ونازعة هيدروجين اللاكتات، مما يشير إلى عبء ورمي أكبر. لا يشارك ورم ويلمز هذه الخصائص.

Keywords

الورم الأرومي العصبي، ورم ويلمز، نازعة هيدروجين اللاكتات، الميتافرين، سرطان الأطفال.

16

Impact of Biologic and Conventical Synthetic DMARDs on Serum Coenzyme Q10 and Malondialdehyde in Rheumatoid Arthritis Patients

Nagham Y. Mohsin, Basil O. Mohammed Saleh, Faiq I. Gorial

Pages: 344-350 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory autoimmune illness. Oxidative stress such as Malondialdehyde plays a major role in the pathophysiology of RA while antioxidants such as Coenzyme Q10 play protect role against inflammation.
Objectives: The study aimed to compare serum concentrations of Coenzyme Q10 and Malondialdehyde in rheumatoid arthritis patients and healthy controls and to evaluate how different types of treatment (biologics and chemotherapy) influence serum levels of them in this disease.
Methods: The case-control study was conducted on 88 individuals (60 had been diagnosed with rheumatoid arthritis and 28 healthy as (Controls). The patients were recruited from the Rheumatology Unit of Baghdad Teaching Hospital in Baghdad, Iraq, during the period from November 2024 to March 2025. They were subdivided into four groups according to the type of treatment (biology, biology & chemotherapy, biology & other, chemotherapy & other). Serum investigations included measurements of anti-cyclic citrullinated peptide antibody, high-sensitivity C-reactive protein, Coenzyme Q10, and Malondialdehyde, measured by using Enzyme linked immunosorbent assay technique.
Results: The study found that the mean (±SD) values of Malondialdehyde were significantly highly increased (705.77 ± 168.83, p<0.0001), while that of Coenzyme Q10 was significantly lower (6.26 ± 1.08, p<0.0001) in RA patients. Also, the mean levels differed significantly among the treatment groups with the biological therapy with the other group having the highest malondialdehyde (and the lowest Coenzyme Q10.
Conclusion: Patients exhibited significantly elevated levels of Malondialdehyde and reduced levels of Coenzyme Q10, indicating oxidative stress. Treatment modalities significantly affect these biomarkers.

Keywords

Antioxidant; Coenzyme Q10; Malondialdehyde; Oxidative stress; Rheumatoid Arthritis.

Abstract

خلفية البحث: التهاب المفاصل الروماتويدي (RA) هو مرض التهابي مناعي ذاتي مزمن، يلعب الاجهاد التأكسدي، مثل مالونديالديهايد (MDA) دورا حاسما في الفيزيولوجيا المرضية لالتهاب المفاصل الروماتويدي، بينما يلعب مضاد الاكسدة، مثل الانزيم المساعد (CoQ10) دورا وقائيا ضد الالتهاب.
الأهداف: تهدف الدراسة الى مقارنة مستويات (CoQ10) و (MDA) في مصل الدم لدى مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي والاصحاء وتقييم كيفية تأثير أنواع مختلفة من العلاج (العلاجات البيولوجية والعلاج الكيميائي) على مستويات (CoQ10) و(MDA) في مصل الدم لدى مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي.
المرضى وطرق العمل: أجريت هذه الدراسة المقارنة على 88 فردا (60 منهم تم تشخيص اصابتهم بالتهاب المفاصل الروماتويدي و28 سليما كمجموعة ضابطة).تم سحب العينات من قسم امراض الروماتيزم في مستشفى بغداد التعليمي في بغداد، العراق، خلال الفترة من نوفمبر 2024 الى مارس 2025. تم تقسيم المرضى وفقا لنوع العلاج (البيولوجي، البيولوجي والكيميائي، البيولوجي وغيره، العلاج الكيميائي وغيره). تضمنت فحوصات المصل قياسات الاجسام المضادة للببتيد السيتريليني الحلقي (anti-CCP)، والبروتين التفاعلي سي عالي الحساسية (hs-CRP) و(CoQ10) و(MDA)، باستخدام تقنية (ELISA).
النتائج: وجدت الدراسة ان متوسط (±الانحراف المعياري) لقيم (MDA) قد زاد بشكل ملحوظ (P<0.0001) بينما كان متوسط (CoQ10) اقل بشكل ملحوظ (P<0.0001) في مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي، كما كان هناك فرق كبير في مستويات (MDA) و (CoQ10) بين مجموعات العلاج، حيث سجلت المجموعة العلاجية البيولوجية مع المجموعة الأخرى اعلى مستويات (MDA) واقل مستويات (CoQ10).
الاستنتاجات: يظهر مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي مستويات مرتفعة بشكل ملحوظ من (MDA) وانخفاضا في مستويات CoQ10، مما يشير الى الاجهاد التأكسدي.تؤثر طرق العلاج بشكل كبير على هذه المؤشرات الحيوية.

Keywords

مضاد للأكسدة، انزيم (Q10) المساعد، التهاب المفاصل الروماتويدي، مالونديالديهيد، الاجهاد التأكسدي.

17

Substance Abuse Among Medical Students in Baghdad: An Updated Concise Descriptive Study

Maha S. Younis, Ashraf A. Jassim, Huda W. Ibrahim, Asala A. Khuraisan

Pages: 281-287 English

Full Text Issues

Abstract

Background: Substance abuse can be defined briefly as the excessive and continuous consumption of psychoactive substances without medical supervision, leading to dependence and adverse health consequences. Substance abuse is an escalating and surging public health challenge in Iraq.
Objectives: To assess the frequency of substance abuse among a large group of senior undergraduate medical students and to identify the associated factors.
Methods: A convenience sample of 388 senior medical students from the College of Medicine/ University of Baghdad during April 2023 took part in this study. Itemployed a modified electronic version of the Drug Addiction Survey Questionnaire (DAST-20) with “yes or no” responses through the college's website anonymously. The survey format included questions about the type, quantity, and duration of abuse, the respondent’s gender and the causes of abuse. Three more questions about the use of alcohol, caffeine, and nicotine were added to the 20 original questions. This study was affiliated with the Department of Community Medicine, College of Medicine, University of Baghdad.
Results: Out of the 388 respondents, 212 students (54.6%) met the criteria for substance abuse according to the study tool. The substances reported to be used included caffeine beverages 94 (24.2%), tobacco (nicotine) 48 (12.3%), Benzodiazepines 23 (5.9%), over-the-counter (OTC) medicines 21 (5.4%), and steroids 8 (2%). Males reported greater rates of substance abuse for nicotine and illicit substances compared to females. Females had higher substance use rates for caffeine at the Baghdad College of Medicine.
Conclusion: The incidence of drug abuse among medical students in Baghdad is rather high, given their level of education and adherence to religious and cultural norms. Coffee, tobacco, and OTC were the most consumed substances, while steroids and sedatives were the least. The use of illegal drugs is higher than before. Tension, anxiety, and depression seem to be the justification.

Keywords

: Anxiety; Baghdad Depression medical students substance abuse

Abstract

خلفية البحث: يمكن تعريف تعاطي المواد المخدرة باختصار على أنه الاستهلاك المفرط والمستمر للمؤثرات العقلية دون إشراف طبي مما يؤدي إلى الادمان وحدوث عواقب الصحية سلبية. أن إساءة استخدام المؤثرات العقلية هو في تصاعد مستمر وتعد من مشاكل الصحة العامة الهامة في العراق.
المنهجية: تم إجراء الدراسة على عينة متعاونة من 388 طالبًا وطالبة في السنين الاخيرة من كلية الطب، جامعة بغداد خلال شهر نيسان 2023. إستجاب الطلبة للاستبيان الخاص باستقصاء وجود إساءة إستعمال المؤثرات العقلية بنسخته الالكترونية المعدلة (DAST-20) المقننه بإجابات "نعم أو لا" عبر موقع الكلية الالكتروني دون كشف المعلومت الشخصية للمشاركين. شمل تنسيق الاستبيان أسئلة حول الخصائص الديموغرافية ونوع وكمية ومدة التعاطي، وأسباب التعاطي. تمت إضافة ثلاثة أسئلة أخرى حول استخدام الكحول والكافيين والنيكوتين إلى الأسئلة العشرين الأصلية. هذه الدراسة تمت ضمن المشاريع البحثية للطلبة تحت إشراف قسم طب المجتمع في كلية الطب، جامعة بغداد.
النتائج: من بين 388 مستجيبًا، استوفى 212 طالبًا (54.6%) معايير تعاطي المواد وفقًا لمعايير الاستبيان. كشفت الدراسة عن وجود إساءة أستخدام للمواد التالية: المشروبات الحاوية على الكافيين 94 (24.2%)، التبغ (النيكوتين) 48 (12.3%)، مركبات (البنزوديازيبين) 23 (5.9%)، الأدوية التي تباع دون وصفة طبية 21 (5.4%)، وعقاقير الكورتيزون 8 (2%). أظهرالذكور معدلات أعلى لتدخين المواد الحاوية على النيكوتين والمواد المصنفة كمخدرات وممنوعه قانونيا حين أن معدلات استخدام المشروبات الحاوية على الكافيين كانت أعلى لدى الاناث. وكذلك الأدوية التي تباع دون وصفة طبية، العقاقيرالحاوية على الكورتيزون ومركبات (البنزوديازيبين).
الاستنتاجات: معدل تعاطي المخدرات بين طلاب الطب في بغداد مرتفع نسبيًا، نظرًا لمستوى تعليمهم والتزامهم بالعادات والتقاليد الدينية والثقافية. القهوة والتبغ والأدوية التي تصرف دون وصفة طبية كانت أكثر المواد استهلاكًا، بينما كانت الستيرويدات والمهدئات الأقل استهلاكًا. استخدام المخدرات غير القانونية أعلى من السابق وكانت التبريرات التي أبداها المشاركين هي للتخفيف من أعراض التوتر والقلق والاكتئاب وضغوط دراسة الطب.

Journal of the Faculty of Medicine Baghdad

Articles in This Issue

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Abstract

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Abstract

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract

Keywords

Abstract